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當(dāng)前位置:首頁產(chǎn)品中心分子生物學(xué)平臺分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)外包CHIP-seq服務(wù)

CHIP-seq服務(wù)

產(chǎn)品簡介

CHIP-seq,指的是結(jié)合位點(diǎn)分析法,作用為研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用。染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結(jié)合位點(diǎn)分析法,是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。

產(chǎn)品型號:
更新時間:2020-05-14
廠商性質(zhì):代理商
訪問量:1265
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CHIP-seq,指的是結(jié)合位點(diǎn)分析法,作用為研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用。染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結(jié)合位點(diǎn)分析法,是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。

 

將ChIP與第二代測序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-Seq技術(shù),能夠高效地在全基因組范圍內(nèi)檢測與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA的片段,并對其進(jìn)行純化與文庫構(gòu)建;然后對富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測序。研究人員通過將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。

 

ChIP-Seq與傳統(tǒng)的ChIP-chip技術(shù)相比具有靈敏度高、靈活性強(qiáng)、分辨率高、不具備其他芯片相關(guān)負(fù)效應(yīng)等明顯優(yōu)勢。

該技術(shù)流程主要分為兩部分:實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)獲取及生物信息分析。

CHIP-seq服務(wù)

實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)獲取流程:

1.        將蛋白交聯(lián)到DNA上。以保證蛋白和DNA能夠結(jié)合,找到互作位點(diǎn)。

2.        通過超聲波剪切DNA鏈。

3.        加上附上抗體的磁珠用于免疫沉淀靶蛋白。

4.        接觸蛋白交聯(lián);純化DNA

5.        定量檢測,檢測合格后進(jìn)行測序文庫構(gòu)建、 DNA 成簇(Cluster generation)擴(kuò)增、高通量測序。

生物信息分析流程見下圖:

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